O Atlético fará sua estreia na Copa do Brasil 2012 no dia 14 de março, às 22h, contra o Cene-MS, no estádio Morenão, em Campo Grande.
Em caso de vitória por dois ou mais gols de diferença, o Galo elimina o jogo de volta, marcado para o dia 21 de março, também às 22h, na Arena do Jacaré, em Sete Lagoas.
Classificando-se para a fase seguinte da competição, o Atlético enfrentará o vencedor do duelo entre Santa Cruz-PE e Peñarol-AM.
Com a participação de 64 clubes, a Copa do Brasil começará em 7 de março e será disputada em seis fases. As finais estão marcadas para os dias 11 e 25 de julho. O campeão garante vaga na Taça Libertadores da América de 2013.